Di dasar lautan terdalam, sebuah tim peneliti menemukan reruntuhan yang misterius dan tidak tercatat dalam sejarah manusia. Ketika mereka mendekati situs itu, sebuah bayangan gelap tampak mengintai dari balik puing-puing. Bayangan tersebut perlahan menyeruak, mengungkap kehadiran entitas yang telah lama tersembunyi dari dunia manusia. Penemuan ini membuka pintu menuju mimpi buruk, di mana setiap langkah mereka semakin membawa mereka ke dalam kegelapan tanpa akhir, Shadows of the Abyss.

Saat tim mencoba mengungkap misteri reruntuhan itu, mereka mendapati diri mereka berhadapan dengan kekuatan tak terlihat yang mulai menguasai kapal mereka. Bayangan itu bukan hanya ancaman fisik, tetapi juga menyerang pikiran mereka, memunculkan ketakutan terdalam yang menghancurkan kepercayaan antar anggota tim. Kegelapan ini lebih dari sekadar ruang kosong; ia adalah entitas yang hidup, haus akan jiwa manusia. Perlahan tapi pasti, mereka terseret semakin dalam ke jurang kegelapan yang dikenal sebagai Shadows of the Abyss.

Dalam perjuangan mereka untuk bertahan hidup, tim mulai menyadari bahwa satu-satunya cara untuk melarikan diri adalah dengan mengorbankan sesuatu yang berharga. Namun, setiap pilihan yang mereka ambil membawa mereka lebih dekat pada kehancuran. Pertarungan antara harapan dan keputusasaan menjadi inti dari perjalanan ini, di mana tidak ada yang bisa memastikan apakah mereka dapat keluar dari Shadows of the Abyss atau menjadi bagian dari kegelapan itu selamanya.