Let the Right One In mengisahkan persahabatan yang berkembang antara seorang anak laki-laki bernama Oskar dan seorang gadis misterius bernama Eli. Oskar adalah remaja yang kesepian dan sering dibuli di sekolah, sementara Eli adalah seorang vampir yang telah hidup selama ratusan tahun, meskipun penampilannya masih seorang gadis muda. Mereka bertemu ketika Eli dan ayah angkatnya pindah ke apartemen sebelah Oskar di sebuah lingkungan suburbia di Swedia. Eli tidak hanya menarik perhatian Oskar karena penampilannya yang aneh, tetapi juga karena sifatnya yang misterius dan kadang menakutkan.

Oskar, yang mulai jatuh cinta pada Eli, kemudian menyadari bahwa gadis ini memiliki rahasia gelap: Eli adalah vampir yang membutuhkan darah untuk bertahan hidup. Eli, yang tidak bisa menyentuh atau memasuki rumah orang tanpa izin, menjalani kehidupan yang penuh dengan kesendirian dan penderitaan akibat sifat vampirnya. Namun, Oskar dan Eli mulai berbagi ikatan yang kuat, saling mengisi kekosongan dalam hidup masing-masing. Meskipun Eli adalah makhluk yang berbahaya, ia tidak pernah bermaksud untuk menyakiti Oskar dan berusaha melindunginya dari bahaya.

Namun, kehidupan Eli tidaklah mudah. Ia harus berjuang untuk mendapatkan darah, dan ayah angkatnya yang sudah tua membantunya dengan melakukan pembunuhan untuk memberi darah segar. Konflik muncul saat Eli menghadapi ancaman dari orang-orang di sekitarnya, serta masalah moral yang datang dengan hidup sebagai vampir. Di akhir film, Oskar memilih untuk tetap bersama Eli meskipun mengetahui siapa dia sebenarnya, dan mereka berdua melarikan diri bersama untuk memulai kehidupan baru, meski penuh dengan bahaya dan kesepian.